Katedra aplikované informatiky zajišťuje výuku všech informatických předmětu v bakalářské i navazující magisterské etapě studia, a to ve společné části (základy programování, práce s AutoCADem, databázové a informační systémy) a pro jednotlivé specializace (automatizace a řízení, pokročilé programování v jazyce Python i C/C++, modelování, zpracování dat).
V rámci projektové výuky se daří vést bakalářské a diplomové práce ve spolupráci s firmou CS-Soft, která se zabývá vývojem software po letectví; studenti zpracovávají praktická témata přímo dle zadání firmy. Z obhájených, kvalitních prací můžeme uvést následující: